Một thế giới không tồn tại người ngoài hành tinh, người đến từ tương lai hay người có siêu năng lực, một thế giới mà ở đó, Nagato Yuki trở thành một cô gái dễ e thẹn, Asahina Mikuru xem Kyon như người xa lạ, còn Kyon trở lại với cuộc sống thường nhật sóng yên biển lặng của một học sinh cấp ba.

Thế nhưng, sự bình thường ấy lại khiến Kyon hoang mang, cậu bắt đầu tìm kiếm những vết tích về sự “bất thường” của các thành viên đoàn SOS. Buổi tiệc Giáng sinh của đoàn SOS do Haruhi đề xuất liệu có thể tiến hành thuận lợi hay không?