Thế giới chúng ta từng tuyên chiến với 10 thế giới khác. 60 năm đã trôi qua từ khi cuộc chiến thắng lợi và sử sách ghi lại cuộc chạm trán này với tên gọi Cuộc chiến Khái niệm. Tất cả chìm vào quên lãng cùng dòng cát thời gian mà những người dân bình thường không hề hay biết về sự thật đằng sau.

Sau cái chết của ông mình–một người đóng vai trò quan trọng trong Cuộc đàm phán, Sayama Mikoto-một học sinh cao trung, bất ngờ gặp được một cô nàng đặc vụ của IAI-Izumo Aviation Institute (Học viện Hàng không Izumo) lạ mặt tự xưng là Shinjou mà không biết được rằng mình sắp phải thay thế người ông quá cố quyết định sự tồn vong của thế giới trước thế lực Khái niệm âm (Minus Concept) đang lớn dần…