Những câu chuyện liên quan đến năm học sinh trung học, Yaegashi Taichi, Nagase Iori, Himeko Inaba, Yoshifumi Aoki và Kiriyama Yui, là tất cả những người thành viên của Câu lạc bộ nghiên cứu văn hóa. Một ngày, họ bắt đầu trải qua một hiện tượng trong đó họ trao đổi ngẫu nhiên các cơ quan với nhau. Năm người bạn phải đối mặt với nhiều hiện tượng khác nhau ở ý tưởng bất chợt của một thực thể bí ẩn được gọi là «Heartseed», tình bạn của họ bị thử thách.